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    三尖杉酯碱诱导HL—60细胞凋亡的生化特征观察<%=id%>

    1.了解凋亡细胞的生化特征。

    2.学会制作DNAladder的一种方法。

      随着对凋亡机制研究的深入,更多凋亡细胞的生化特征被发现(见第1部分第7章调亡细胞的识别)。但对凋亡细胞的生化特征发现最早、最明显的特征被称为DNA ladder(梯状电泳带)。由于大多数程序性死亡的细胞中(也发现少量凋亡细胞中,这个生化特征不明显),内源性核酸内切酶活化,核DNA随机在核小体的连接部位被打断,成为寡聚核小体,若对核DNA进行琼脂糖凝胶电泳,可显示以180-200bp为基数的DNAladder特征;相比之下,正常细胞的DNA不降解,电泳条带表现为一大分于片段;坏死细胞的DNA虽然也存在降解,但由于存在各种长度的DN*段,无法形成梯状带纹,表现为连续分布的弥散条带。

      提取细胞中的DNA,可用传统的蛋白酶K消化和酚、氯仿、异戊醇抽提的方法,也可以用其他方法。本实验提取细胞中DNA的方法是:利用在高盐离子浓度时DNA溶解度降低被析出,而在低盐离子浓度时DNA易被溶解的特性来纯化并提取DNA。首先用一种变性溶液(溶液A)使膜蛋白变性,从而使DNA从破碎的膜中释放出来,再加人一种高盐离子浓度的溶液(溶液B)和一种树脂(溶液C),溶液B的作用是使DNA从溶液中析出并终止溶液A的作用,析出的DNA被吸附到溶液C上,继后用洗涤液(溶液D)洗去杂质后,再加人低盐离子浓度的溶液(溶液E),则DNA从溶液C上被洗脱下来,溶解于溶液E中。

      利用上述方法提取正常、凋亡和坏死细胞核中的DNA,进行DNA琼脂糖凝胶电泳,在紫外光下可观察和拍照3种细胞的DNA电泳条带。

    ***仪器:    微量加样器,恒温水浴锅,高速离心机,电泳仪和电泳槽,暗箱式紫外透射仪,微量离心管,吸头。

    ***材料:   HL—60细胞,动物基因组DNA提取试剂盒(购自北京鼎国生物技术发展中心,内含溶液A、B、C、D和E等,其中溶液D在使用前以1:1加入无水乙醇)。

    ***试剂: 5XTBE,6XDNA加样缓冲液,1%琼脂糖,溴化乙啶溶液(EB)。

    (一)提取细胞DNA

    1。将上面实验留下的3瓶细胞,按原实验分组的顺序,分别作为①对照组;②加药组(内有大量凋亡细胞,也有一些正常和坏死细胞);③坏死组(可通过高温或微波处理使细胞坏死)。

    2.将3瓶细胞离心(1$00r/rain、5min)收集后分别移入3个1.5 mi.微量离心管中,以下的步骤3个样品同样操作。

    3.加入300flL溶液A(使蛋白变性),用微量加样器轻缓吹打使之变成清亮的溶液,室沮放置5raino

    4.加入800pL溶液B和25pL溶液C(树脂,用前混匀),用微量加样器轻缓吹打使之混匀,室沮放置20min。这一步作用是使DNA从溶液中析出并被吸附到树脂上。

    5.至少8000r/rain离心5min,弃上清。

    6.加人400pL溶液B,用微量加样器轻缓吹打使之混匀,至少8000r/rain离心5rain,弃上清。此步骤欲再次提高盐浓度,使DNA与树脂结合更紧密。

    7.加入500flL溶液D(用于洗杂质,用前1:1加入无水乙醇),轻缓吹打使之混匀,至少8000r/rain离心30~60 s,弃上清。

    8.重复步骤7。

    9.至少12000r/min离心30-60 8,吸干上清,室沮晾干约10millo

    10.加入50-100pL溶液E,混匀后置40-$OqC水浴,1-5mino

    11.至少12000r/min离心30-60 8,取上清液,即为DNA,4℃保存(若长期使用,需放于—20℃)。

    (二)琼脂糖凝胶电泳

    1.配制凝胶和胶板制备

    (1)配制所需的电泳缓冲液(通常为0.5XTBE)。

    (2)用橡皮膏封住(注意封严!)电泳凝胶床的两端开口,形成一个胶模,插好梳子后平放于工作台上。

    (3)在锥形瓶中根据需要加入一定量0.5XTBE电泳缓冲液,加入使终浓度为1%的琼脂糖粉,瓶口盖上锡箔纸,在水浴或微波炉上加热至琼脂糖完全溶解。

    (4)溶液冷却至60℃时,加入EB(注意带手套操作!)至终浓度为0.5μg/mL,充分混匀。

    (5)将温热的琼脂糖溶液倒人胶模中,凝胶的厚度在3-5 mm圆之间。检查是否有气泡,若有可用吸管小心除去,静置凝胶。

    (6)凝胶完全凝固后(应为浅乳白色),通常需要在室沮中放置30-45min,除去橡皮膏,将装有凝胶的电泳凝胶床放人电泳槽。也可同时制作几块凝胶,待其固化后用保鲜纸包住以防水分挥发,置4℃保存,通常在数日之内可以使用。

    (7)加入恰好没过胶面约1-2mm:的0.5XTBE电泳缓冲液,移去梳子,即可见形成

    的加样孔。

    2.加样

    10LDNA加入2PL加样缓冲液,每孔点样10Pl(记录点样顺序)。使用加样缓冲液目的:①增大样品密度,确保DNA均匀进入样品孔内;②使样品呈现颜色,利于加样操作;③含有电场中向阳极泳动的染料,可掌握速率。

    3.电泳

    盖上电泳槽并通电,使DNA向阳极移动(电泳过程中,EB向阴极移动,与DNA相反)采用1-5V/cra的电压降(按两极间距离计算),可在室沮下电泳,若气温太高,需在电泳槽周围放置冰块,电泳至澳酚蓝(凝胶中呈蓝紫色)和二甲苯青(凝胶中呈蓝色)迁移到距凝胶前沿1-2cm处停止电泳(约30-45mia)。

    4.观察和摄影

    切断电源,从电泳槽中取出电泳凝胶床,将凝胶置于紫外透射仪下观察电泳结果,如有必要可进行拍照。

    (点击下面的链接查看图片,如果你禁止了弹出窗口,你将无法看到结果图片或视频!)

             

    1.画出你观察到的凋亡、坏死及正常细胞的DNA琼脂糖凝胶电泳图谱。

    2.列出你实验中所用的电泳条件。

    1.操作要温和,防止大分子DNA被打断,影响实验结果。

    2.若细胞较多,要适当加大溶液A(蛋白变性剂)和溶液C(吸附DNA的树脂)的用量。

    3.根据实验的具体情况,对琼脂糖浓度、梳子类型、上样量、电泳条件如电泳所加电压和电泳时间等要进行预实验,使能明显区分出3种细胞的条带,特别是凋亡细胞的梯状电泳带。本实验给出了参考值,可根据实际条件进行调整。

    4.EB可嵌入双链核酸中,是一种诱变剂,操作时要戴手套,如果粘到手上,要及时用大量清水冲洗。

    1.试述凋亡细胞的生化特征。

    2.试述本实验中溶液A、B、C、D、E在提取DNA中的作用。

         

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