近期来自华中科技大学生命科学与技术学院的研究人员在《核酸研究》（Nucleic Acids Research）杂志（IF 7.8）上发表了题为“MicroRNA and transcription factor co-regulatory network analysis reveals miR-19 inhibits CYLD in T-cell acute lymphoblastic leukemia”的研究论文，报告了关于急性T淋巴细胞白血病中miRNA和转录因子共调控网络的生物信息学研究的最新成果。
领导这一研究的是华中科技大学生命科学与技术学院的郭安源教授，主要从事生物信息学和系统生物学在复杂疾病中的研究，包括数据整合、数据库构建、miRNA调控、比较基因组学和二代测序数据的分析研究等。
急性T淋巴细胞白血病（T-ALL）是一种进行性的血液系统恶性疾病，以高外周血细胞计数、原始细胞增多、中枢神经系统浸润和纵隔肿瘤为特征,好发于儿童和青少年。当淋巴母细胞（一种未成熟的白细胞）变成恶性、不受控制地增殖并迅速扩散至全身时，T-ALL便发生了。该疾病进展凶险，如果不进行治疗，疾病在几周内就可致命。近年来尽管多药联合、大剂量化疗等治疗手段的不断改进,以及各类造血干细胞移植的应用和推广,但是该病的总体疗效和预后比更常见的B细胞系淋巴细胞白血病仍然要差很多。目前对于这一疾病发病的具体分子机理和调控机理还不清楚。
在这篇文章中，郭安源教授课题组以miRNA和转录因子的共调控角度为切入点，运用生物信息学方法，预测miRNA和转录因子与疾病基因之间形成的共调控前馈环模块，并由此构建共调控网络。通过深入分析该调控网络获得了其中的核心miRNA和基因。并进一步对其中核心基因miR-19与CYLD在T-ALL中的分子机理进行了研究，首次揭示了miR-19抑制CYLD蛋白的产生，继而激活下游的NFKB信号通路，导致T淋巴细胞增殖失控。
这项研究成果从系统网络水平研究急性T淋巴细胞白血病的发病机理和调控过程，为其诊断和治疗提供理论依据，并为复杂疾病的研究提供了计算和实验交叉的新思路和方法。（来源：生物通 何嫱）
|
