大约在20世纪60年代初期，凯伊豪、大卫森等不明飞行物研究者继续抨击中央情报局，要求其公开关于UFO的信息。大卫森宣称中央情报局：“自从1951年起，就开始制造UFO狂潮作为冷战的心理战争工具。”虽然公众一再要求召开美国国会意见听取会，公开关于UFO的所有信息，但收效甚微。
然而，在1964年，白宫讨论了如果在太空发现外星人信息或UFO报告，以及UFO现象有了新的进展该如何处理的问题。此后，国防委员会情报处约翰·麦克隆请求中央情报局更新对UFO的评价。根据这个请求，科学情报处要求联络部门从国家航空现象调查委员会获得各种各样最新的UFO实例和报道。由于该组织的创立者之一凯伊豪在研究中不再积极，中央情报局官员会见了该组织的负责人理查·豪尔，豪尔给了该官员其组织资料库中最新的UFO现象实例。
科学情报处官员在检查了这些材料之后，副处长唐纳德·克伯林向麦克隆保证自从20世纪50年代以来UFO现象没有发生太大的变化。仍然没有证据证明UFO会对国家安全造成威胁或者说它们是“天外来客”。克伯林告诉麦克隆，科学情报处仍在监控UFO报道，其中包括空军的调查“蓝皮书”计划。
同时，由中央情报局负责管理UFO最新的内部评论。公众向空军施加压力要求建立一个专门的、特别的委员会来检查“蓝皮书”计划。因此，空军组织了一个委员会，由空军科学咨询小组成员布赖恩博士负责，该委员会成员还包括著名天文学家卡尔·萨根。他们的报告也没有新的发现。报告称：“UFO不会威胁国家安全，并且没有一个UFO现象表现出超越人类科学技术的特征。”委员会建议由一个大学主要负责协调该计划以便全国研究UFO现象，并能给出确定的结论。
1966年，军队议院委员会也举行了简短的听证会，并得到了相同的结论。空军书记哈罗德·布朗向委员会保证大多数的UFO现象都很容易解释，并且还没有证据表明外星人曾经拜访过地球。然而他又告诉委员会成员，空军必须以开放的心态继续调查所有的UFO报道。
在布赖恩委员会的报告、议会听证会、罗伯特森博士在哥伦比亚广播节目的谈话中都有情报局参与UFO现象的分析。1966年7月，空军再次请求情报局对1953年罗伯特森小组的整个报告，以及杜瑞德就该报告的分析评论进行解密，但是情报局又一次拒绝了该请求。科学情报处副处长卡尔·韦伯写信给空军：“我们最担心的是不能得到情报局支持的小组的更多的信息。”韦伯在信中提到公众已经有一个删减过的版本，韦伯的这种反应是目光短浅并且考虑欠周道的，因为他只关注了罗伯特森小组13年前做的报告和中央情报局在UFO调查中的角色。而《星期六评论》杂志社的科学版主编在他1953年发表的文章中批评“删节本”，要求公开完整文件时，他关注的是在全面范围内对UFO现象的调查中情报局所扮演的角色。
情报局官员并不知道在1966年6月6日，一位来自亚利桑纳大学的大气物理学家詹姆斯·麦克唐纳德已经在代顿市空军基地看到过杜瑞德对罗伯特森小组进程的报告。然而，在麦克唐纳德于6月30日返回基地要抄写这份报告时，空军却称这份报告是情报局的保密文件，不能给他查阅。于是麦克唐纳德公开声称中央情报局是隐藏在空军背后的秘密指挥，这是他们掩盖UFO事件的一种手段。他要求公开完整的罗伯特森小组和杜瑞德的报告。
迫于公众的压力和布赖恩委员会的建议，空军在1966年8月向外宣布，他们正与一所大学联系，以便对UFO现象展开全面而细致的调查。新的计划要减少美国政府自从知道UFO现象起所一直隐瞒的不断上涨的预算开支。10月7日，科罗拉多大学接受了325 000美元与空军一起合作进行了长达18个月的飞碟研究工作。著名物理学家、国家标准局前任局长爱德华·康顿博士主持并领导该项工作。康顿是一个“不可知论者”，他评价自己对问题只持开放的思想而毫无偏见。他认为外星人是“不确定但不是不可能的”。美国空军准将爱德华·吉尔乐和空军研究发展处的托马斯·拉查弗德也参与了这项计划。
1967年2月，吉尔乐与情报局的国家照片分析中心主任卢达尔联系，提出与该中心建立一种非正式的联络关系，希望能够为康顿委员会在检测UFO照片上提供技术指导和服务。卢达尔与国防委员会情报处的杰克·史密斯达成协议，决定以“维持一层玻璃”的方式进行合作。情报局与照片分析中心都保持低调，他们不参与委员会的任何结论，而且国家照片分析中心也不参与委员会的工作。
然后，拉查弗德却请康顿委员会的工作人员拜访照片分析中心以讨论技术方面的问题，以及了解照片分析中心的专用分析设备。
1967年2月20日，康顿和委员会的其他4名成员参观了照片中心。拉查弗德向他们强调，照片分析中心的任何工作都不能认为是情报局的工作。而且，照片分析中心的各项工作都有严格的技术特征。在听完指导方针后，该小组听取了有关服务和设备上的一些介绍，这是由拉查弗德负责装备的，情报局用来分析一些UFO照片的设备。这在其他地方是不可能得到的设备，这给康顿和他的成员们留下了非常深刻的印象。
1967年5月，康顿和他的小组成员又在照片分析中心会面。这次他们听取了对在俄亥俄州拍摄的一些UFO照片的分析。分析解释了这个现象并再一次让他们感受到这项分析技术的先进性。
康顿评论道：“这是第一次能经得起调查的对UFO现象的科学分析。”
他们还讨论了委员会的计划：向全体美国公民征集他们手中的UFO照片，并发布了一整套行之有效的UFO照片拍摄指导办法。此外，中央情报局官员同意康顿委员会公开部分删减的全部杜瑞德报告。
1969年4月，康顿委员会公开发表了他们的学术报告。最终，报告的结论是：在对过去21年的UFO研究中没有任何事实根据证实UFO是“天外来客”，因而对此现象也无须再做进一步的调查研究。这份报告建议空军停止“蓝皮书”计划。而且这份报告也没有提及在康顿的调查中情报局所参与的活动。国家科学院审查康顿报告并同意了这个结论：“在过去的20年里没有根据证实UFO调查是可以优先考虑的事情。”报告最后称：“在现有的知识水平上，UFO不太可能的解释是：‘它是外星人的交通工具。’”
在康顿委员会和国家科学院的建议下，空军部长罗伯特·西曼斯于1969年12月17日宣布终止“蓝皮书”计划。
本文的作者Gerald K. Haines是一位美国的现当代历史学家，著有《美国外交关系》《美国政府特殊档案参考指南》等。
