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瑞典建国家生命科学中心 开展欧洲云杉测序工作

来源:科学时报       更新时间:2010-5-21 11:18:53
 


欧洲云杉的测序工作即将开始

  一年前,瑞典的克鲁克-爱丽线·瓦伦堡基金会宣布,提供1000万美元研究经费,测定欧洲云杉的基因组序列;如今,据最新出版的《科学》杂志报道,首都斯德哥尔摩的官员表示,将于本周为一幢装备了最新DNA测序仪器的新大楼举行落成典礼,并在2013年前测出这种“圣诞树”的基因组草图。

  欧洲云杉是一种四季常青的针叶状松科植物,树干直、树冠成尖塔形,常作圣诞树之用;不仅如此,因其木材质地柔软,纹理通直,因而是建筑、家具、乐器和造船的材料。

  《科学》的文章认为,对瑞典来说,这幢新建筑的意义远远不止这一单独的研究项目。它是瑞典生命科学实验室最新发展的一个见证。

  生命科学实验室联合了瑞典的多个研究机构,并在斯德哥尔摩和瑞典中部城市乌普萨拉附近设立了两个办公地点。与以前将经费分配给尽可能多的科学家的传统做法不一样,这一次,瑞典政府计划在生命科学实验室上投资7500万美元,希望将之办成以技术驱动的一个国家生命科学中心,相当于美国马萨诸塞州剑桥市的博登研究所。遗传学家克斯汀·林德布莱德是生命科学实验室位于乌普萨拉分部的负责人,同时也在博登研究所工作,他说:“这是一个经过谨慎思考的决定,我们将与众不同。”

  卡罗林斯卡医学院、斯德哥尔摩大学和皇家技术学院均位于斯德哥尔摩,多年以来,这几所机构的官员总是在一起讨论如何在生物学领域创建一个国家研究中心。然而,直到瑞典政府最近为生命科学的几个领域投入经费后,这个梦想才开始变为现实。2009年,这三家机构联合起来获得了“分子生物科学”领域的大部分经费,之后,又联合另一经费获得者乌普萨拉大学,形成了生命科学实验室。

  到2011年,位于斯德哥尔摩的新大楼将可容纳200多位研究人员。除了测序欧洲云杉的基因组序列外,生命科学实验室还将帮助瑞典发挥其人口数据库和生物银行众多的优势,比如最近启动的生命基因项目。

  林德布莱德说,生命科学实验室“是我们真正需要用来与其他地方竞争,并分析我们自己的数据的地方”。

  作为一种飞跃,瑞典将创建欧洲最大的基因组中心。实际上,世界各地已经有相当多的大型基因组中心,比如,瑞典生命科学实验室的测序量只相当于英国威康信托基金会桑格研究院的40%。但是,瑞典的这个研究中心将史无前例地整合基因组学和蛋白质组学,从而脱颖而出。

  目前人类蛋白质图谱项目已经落户乌普萨拉大学和皇家技术研究院,该项目计划在2014年前创建几乎针对人类每个蛋白质的抗体。皇家技术研究院的约克蒙·伦德伯格说:“生命科学实验室将是唯一一个拥有针对所有人类蛋白质抗体的实验室,并且有能力测序人类基因组,这是一个非凡的地方。”

  科学家表示,他们将利用人类蛋白质图谱的抗体来测试人类蛋白质的亚细胞位点。还有科学家计划用这个图谱来分析波罗的海的生态系统。

  如今,欧洲云杉是这个新实验室的中心任务。迄今为止,没有任何一种松科植物的基因组被测出,部分原因是这些植物充满了重复的DNA序列。欧洲云杉和人类基因组也许有可比较的基因数据,但前者的数量比后者大7倍至10倍。乌普萨拉大学云杉测序项目的负责人说:“在被测序的物种中,云杉的基因组是最大、最复杂的一种。我们希望鉴别出控制木材特性的基因。”

  通过云杉基因组项目,生命科学实验室与乌普萨拉大学建立起合作关系,这也将让更多瑞典科学家相信,这个项目也将有益于他们。一位学者表示:“瑞典的绝大多数大学都在观望,看我们能否建造有益于他们的基础设施平台。现在,我们将向他们证明我们能。”

  《科学》的文章认为,生命科学实验室可能也将帮助乌普萨拉和斯德哥尔摩地区的科学家走在一起,它们彼此间曾经是对手。芬兰籍病理学及人类遗传学家阿诺·帕罗蒂是威康信托基金会桑格研究院医学测序负责人,他表示,生命科学实验室代表了过去“黑暗十年”的一种转变,那时北欧日尔曼系国家都不能用他们的财富资助战略性的研究事业。“瑞典比荷兰或挪威醒得更

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