大豆基因组重测序表明:野生大豆遗传多样性更高 |
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| 来源：科技日报 更新时间：2010-11-16 11:21:39 |
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最新发现与创新
本报深圳11月14日电（记者刘传书）香港中文大学、华大基因研究院、农业部、中科院等单位合作的“大豆回家”项目，在大豆基因组研究方面获研究成果:“31个大豆基因组重测序揭示遗传多样性和进化选择模式”，今天在《自然—遗传学》上在线发表。该研究首次对野生大豆和栽培大豆全基因组进行了大规模遗传多态性分析，为全球大豆的遗传学研究提供了非常有价值的资源，为大豆种质资源保护和分子育种带来新的科学启示。
研究人员运用新一代测序技术对17株野生大豆和14株栽培大豆进行了全基因组重测序，利用SOAP软件v2.18比对到大豆的参考基因组上，总共发现了630多万个单核苷酸多态性位点（SNPs），建立了高密度的分子标记图谱。同时通过SOAPdenovo软件分别对野生大豆和栽培大豆进行组装，从而鉴定出了18万多个两种大豆中获得和缺失变异（PAVs），得到了在栽培大豆中获得以及丢失的基因。此研究还发现了大豆基因组不同于其它作物植物的两个显著特点：存在较高程度的基因连锁不平衡和较高比例的单核苷酸非同义替换/同义替换比例，这提示在大豆育种方面，分子标记育种比基因图位克隆可能会拥有更多的优势。这些发现为大豆的遗传学研究以及分子育种提供了重要的多态性标记，同时也补充了大豆的基因集，为大豆基因组的进一步研究提供了大量的宝贵数据。
研究人员发现，与栽培大豆相比，野生大豆有着更高水平的遗传多样性，这表明人类的选择对栽培大豆的遗传多样性产生了很大的影响，导致了狭窄的生物多样性，对可持续种植带来负面影响。而对野生大豆的分析表明，随着野生大豆生存环境的减少，野生大豆的有效群体大小在减少，这表明了野生种质资源保存的重要性和紧迫性。
(责任编辑：罗园)
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